6、调整肠胃
藿香含挥发油，能促进胃液分泌，增强食欲和消化机能，并对胃肠有解痉、防腐作用，故有芳香健胃之功，而为本方主药。
紫苏、生姜、陈皮，均能使消化液分泌增加，抑制肠内异常发酵，促进积气排出，故可加强主药藿香行气健胃之力。
紫苏尚可增强胃肠蠕动;陈皮则可缓解胃肠平滑肌之痉挛;白术所含挥发油少量时亦能缓和胃肠蠕动;半夏则有较为明显的镇吐效能。
诸药配合，以纠正胃肠功能紊乱，有利于呕吐、腹泻等症状的缓解。
7、发汗解热
藿香及生姜均具有促进发汗之功;紫苏有解热之效，合而能解表祛湿。
8、利尿作用
白术利尿作用较为明显;茯苓亦有一定利尿效果，合而又能利水渗湿。
藿香正气水的注意事项
9、祛痰止咳
桔梗所含皂甘，及陈皮所含挥发油，均有剌激性祛痰作用;半夏的镇咳作用明显;甘草则既能祛痰，又能镇咳;陈皮对气管及支气管有轻度扩张作用，而有助于平喘。诸药配合，有祛痰、止咳平喘之效。
10、抑菌抗病毒
厚朴有广泛抗菌作用，其抗菌成分较稳定，不易被热、酸、碱等所破坏。试验证明，其对金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、痢疾杆菌等均有抑制作用。紫苏对大肠杆菌、痢疾杆菌、葡萄球菌等亦有抑制作用。
藿香所含广藿香酮则对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、甲型溶血性链球菌、肺炎双球菌，均有抑制作用。
