实火虚火，能治上、中、下三焦之火，能治气分、血分之火。湿热、食积之火，只是加工的方法不一样。书中记载：‘‘[时珍日]黄连人手少阴心经，为治火之主药，治本脏之火，则生用之;治肝胆之实火，则以猪胆汁炒;治肝胆之虚火，以醋浸炒;治上焦之火，则以酒炒;治中焦之火，则以姜汁炒;治下焦之火，则以盐水炒;治气分湿热之火，则以茱萸汤浸炒;治血分块中伏火，则以干漆末调水炒;治食积之火，则以黄土研细调水和炒。” 黄连泻上焦心火，泻中焦脾胃湿热之火，泻下焦肝胆之火，这是公认的。泻三焦之火是否包括肺火和肾火呢?《本草纲目》上没有明说。中医传统上确实很少用黄连治疗肺火和肾火之病症。《本草正义》说黄连“能泄降一切有余之湿火，而心、脾、肝、肾之热，胆、胃、大小肠之火，无不治之。”提到了清肾火，但还是没有提到清肺火。 黄连是《本草纲目》中附方最多的一味药，计有75方。说明古代使用得非常广泛。其所治病症绝大多数为感染性疾病，并以消化系统病症为多，并遍及全身各个部位。也有少量的其他病症，如消渴尿多等。但没有一张是治疗有关肺病和肾病的附方。
黄连的应用 竟能治那么多常见病
由于黄连的抗感染作用，近代治疗肺结核、肺脓疡、肺霉菌感染、百日咳等肺部感染性疾病等都是有报道的。中医临床一般对肺支气管感染性疾病，黄连习惯上是不用的，关键是对肺部感染的效果不是很好。
泌尿系统感染中医辨证下焦湿热，黄连是常用的，并且常与黄柏同用。
(二)清热解毒抗感染，黄连素不能取代黄连
黄连传统多用于治疗热病温病、腹泻痢疾、疮疡疖肿以及心慌、心悸、失眠、冒痛、消渴、口疮等病症。
黄连是中医传统中使用得最早、最广泛的清热解毒药、抗感染药。用于各种细菌、病毒等感染性疾病，尤其对急性胃肠炎、急性菌痢效果最好。
由于感染性疾病的复杂性和普遍性，古代曾制定了大量的清热解毒的复方，以增强疗效。在当前抗菌生素广泛使用的情况下，中药只有在特定的情况下才会使用。黄连的复方能增效和改善病情。
黄连的应用 竟能治那么多常见病
黄连素(小檗碱)是从十大功劳等植物中提取的，与黄连的作用大致上是一致的，但并不能取代黄连的全部功能，包括抗病原体作用。在许多疾病的治疗中，口服黄连素片不及黄连复方煎液的疗效好。
(三)关于治疗慢性胃肠道疾病
黄连治疗各种慢性胃肠道疾病在古代就有许多良方，如泻心汤、左金丸、香连丸、戊己丸、黄连理中丸等，至今还在慢性胃十二指肠炎症、溃疡和慢性肠炎的治疗中广泛使用。这些配方非常合理，既消除了炎症，又调节了胃肠功能，因此，对胃痛、腹泻有很好的疗效，不比西药差，而且没有副作用。如果在剂型上加以改进，使服用、携带更加方便就更受欢迎了。
左金丸中黄连、吴茱萸同用，中医称辛开苦降、辛开苦泄。黄连苦寒与吴茱萸辛温同用，称寒热反佐。黄连理中丸黄连、炮姜同用，也是苦寒与辛温同用，寒热温凉反佐。既能消除炎症，又能解痉止痛和抑制渗出。
