《神农木草经》中，黄连被列为药中上品;明清时，黄连曾是贡品，四川产区每年必须进贡一定数量给宫廷。清代，“黄连运售出洋，岁值数万”(《南川乡土志》载)。近代，随着中西医药学的深入研究和发掘，黄连的药用价值有了更大的提高。
黄连含小蘖碱(也称黄连素)、黄连碱、药根碱、棕榈碱等多种生物碱，其中小蘖碱是主要成分。黄连或小蘖碱是天然的广谱抗菌药物，对多种杆菌、球菌、真菌、病毒、原虫等都有较强的抑制作用，善治菌痢、腹泻、胃肠炎等症。小蘖碱还能加强白细胞的吞噬功能，有良好的消炎、利胆、扩张血管和降低血压的作用。中医认为黄连性味苦寒无毒，有泻火解毒、清热燥湿、清心除烦、止吐杀虫的功能。广泛用于高热、时行热毒、伤寒、泻痢、蛔虫病、咽喉肿痛、口疮、痈疽、烧烫伤等各种热证、湿热证、寒热错杂的证候和各种血证。
黄连治病的历史源远流长，疗效家喻户晓。用它组成的名方，在《伤寒论》中就有12个，约占该书方剂的10%。此书唐代时流传到朝鲜、日本，这些疗效卓著的方剂至今仍为中、日、朝及南洋各国的中医师所常用。唐代《千金要方》、《外台秘要》两书中，有黄连的方剂达260余方，可见黄连治病之广。谚语云：“家有黄连，百病可愈。”黄连可谓是居家旅行的必备良药。目前有膏、丹、丸、散、片、针剂等各种黄连制剂。
性味归经
1.性味：性寒，味苦。
2.归经：归心、肝、胆、胃、大肠经。
功效与作用：
泻火，燥湿，解毒，杀虫。治时行热毒，伤寒，热盛心烦，痞满呕逆，菌痢，热泻腹痛，肺结按，吐、衄、下血，消渴，疳积，蛔虫病，百日咳，咽喉肿痛，火眼，口疮，痈疽疮毒，湿疹，汤火烫伤。
①《本经》："主热气目痛，眦伤泣出，明目，肠辩腹痛下痢，妇人阴中肿痛。"
②《本草经集注》："解巴豆毒。"
③《别录》："主五脏冷热，久下泄辩脓血，止消渴，大惊，除水利骨，调胃厚肠，益胆，疗口疮。"
④《药性论》："杀小儿疳虫，点赤眼昏痛，镇肝去热毒。"
⑤《本草拾遗》："主羸瘦气急。"
⑥《日华子本草》："治五劳七伤，益气，止心腹痛。惊悸烦躁，润心肺，长肉，止血;并疮疥，盗汗，天行热疾;猪肚蒸为丸，治小儿疳气。"
⑦《仁斋直指方》："能去心窍恶血。"
⑧《珍珠囊》："泻心火，心下痞。酒炒、酒浸，上颈已上。"
⑨王好古："主心病逆而盛，心积伏梁。"
⑩《本草衍义补遗》："以姜汁炒，辛散除热有功。"
⑾《纲目》："解服药过剂烦闷及轻粉毒。"
⑿《本草新编》："止吐利吞酸，解口渴，治火眼，安心，止梦遗，定狂躁，除痞满。"
⒀《本草备要》："治痈疽疮疥，酒毒，胎毒。除疳，杀蛔。"
黄连能治疗哪些疾病?
1.用于湿热中阻、泻痢腹痛。治湿热互结，恶心呕吐等，常与半夏、干姜等配伍，如半夏泻心汤。若治外邪入里，泻痢身热，配伍黄芩、葛根、甘草等，即葛根黄芩黄连汤。若治泻痢脓血，常配伍白头翁、黄芩、秦皮等，即白头翁汤。配伍木香，黄连清热燥湿止痢;木香行气止痛，除里急后重。两药相配用于治疗湿热痢疾之腹痛、里急后重等症有良效。
2.用于热病高热。治高热烦躁，常与黄芩、黄柏、栀子等泻火解毒药物配伍，即黄连解毒汤。
3.用于心烦失眠，肝胃失和，呕吐吞酸。配伍肉桂，因黄连苦寒泻心火，抑制偏亢之心阳，反佐少量辛热之肉桂，以导致心火下交于肾，使心肾相交，心火不亢、肾水不寒。两药相配，用于心肾不交，上热下寒，证见失眠心烦，口舌生疮，小便清长，四肢不温者。配伍吴茱萸，黄连苦寒，善清胃热以治呕逆;吴茱萸辛热，善泄肝和胃降逆。两药合用，以黄连为主，少佐吴茱萸以制黄连之苦寒太过，方名左金九，有治肝和胃、降逆止呕之功。治肝火犯胃所致的脘胁胀痛、吞酸嘈杂、呕吐口苦等症。
4.用于痈肿疮毒，皮肤湿疮，目赤肿痛。治热毒疮疡，常配伍黄芩、黄柏、栀子等，即黄连解毒汤。治皮肤湿疮，可黄连制膏外用。治目赤肿痛，以本品用人乳浸汁滴眼。
5.用于血热出血。治热盛迫血妄行的吐血、衄血等，常配伍大黄、黄芩等，即泻心汤。配伍生地，主治温热病，热盛伤阴，证见发热不退，神昏谵语，夜寐不安者，因黄连清热泻火解毒，生地清热凉血养阴。两药相配，既清热又养阴;既清气又凉血。
用法、用量与禁忌用法：
3～6g，水煎服，亦可研末外用
毒副作用
黄连及其提取物极少发生中毒反应，黄连素肌注及口服过量可出现过敏反应，静脉滴注易发生急性心源性脑缺氧综合征。
