从非典到甲型h1n1流感，每次疫情来袭之时，板蓝根由于其具有很好的清热解毒、凉血利咽功效，都会成为众人关注的焦点之一，板蓝根的功效还具有抗菌抗病毒作用，抗钩端螺旋体作用，解毒作用，提高免疫功能，抗肿瘤作用，对白血病作用，此外用板蓝根煎剂治疗非典型性肺炎、流行性脑脊髓膜炎、白喉，用板蓝根配合大青叶、羌活治疗上呼吸道感染，用板蓝根肌肉注射治疗带状疱疹、单纯疱疹及流行性腹泻等，均有不同程度的功效，被捧为防治甲流流感必备药品。
板蓝根的副作用：
然而专家却认为，板蓝根的功效根虽好，但板蓝根也是有副作用的，也不是人人都适合。有中医专家表示，SARS、季节性流感、甲型h1n1流感都是由病毒引起的呼吸道疾病，因此作用机理都是抗病毒。而板蓝根抗流感缺乏严格的循证医学上的证据，仅仅停留在多年来具体病例积累的临床经验上，经验证明中药板蓝根可能作用于人体细胞保护，使其免受病毒侵害，或者是提高了人体免疫机能。
目前还不能证明板蓝根对甲型h1n1流感有治疗作用，公众预防甲型h1n1流感的主要方法仍是坚持正常的饮食休息，保持人体正常的免疫力，出现症状及时就医。
两次大范围病毒流行证明，板蓝根不能防治甲肝、非典，不应该乱用、多用，但由于板蓝根在配合其他药物协同作用下，对防治流感、流行性乙型脑炎、流行性腮腺炎病等还是具有较好疗效的。
中药板蓝根抗病毒作用机理研究，首次发现板蓝根具有清除由死亡病菌引起内毒素的功能，可充当内毒素“清道夫”。
