中医认为，口腔溃疡是一个典型的“形之于外，而发之于内”的病变，意思就是说，口腔溃疡的病变虽然在局部，但其形成的原因并不是口腔或者舌头的疾病所致，而通常是机体上火的一个外在表现。
而火又有虚实之异，往往初起为实证，反复发作则由实转虚。实火表现为溃疡数目多，溃面鲜红，范围较大，形状不规则，溃面多被黄色渗出物遮盖，周围黏膜充血明显，多发于青少年，常伴口内灼痛，咽干口渴，尿赤便干。其病机为胃火盛，胃火上窜则生口腔溃疡，伴有口臭；胃火下迫则腑气不通，引起便秘。
火气存于体内怎么办？中医治病一个重要思想就是“疏导”，而非用药物“强行浇灭”。因此在治疗上应该注意，除了对口腔溃疡要施以局部治疗外，还应注意保持大便的通畅。当大便通畅后则胃火从大便而泄，能够从根本上治疗口腔溃疡病。而且大便通畅往往提示胃肠功能的正常，能够起到预防口腔溃疡发生的作用。目前流行的排毒疗法就是通过通畅大便，使体内毒素排出体外，起到很好的治疗口腔溃疡的作用。
在具体用药上，局部采用维生素正数片研成细末，涂敷溃疡面上。每日4次并内服牛黄清胃丸等药，保持大便偏软状态。同时注意饮食清淡，多食富含纤维素的食品。
虚火型表现为溃疡数不多，呈圆形或椭圆形，溃面嫩红，周围黏摸轻微充血，口干，手足心热，大便干。这类口腔溃疡病机为肾阴亏虚，因此在治疗上不能使用大量的清火通便药，而应该使用养阴清热之品，如麻仁润肠丸等成药，既润肠又不伤阴。
