引起习惯性流产的病因复杂，有免疫性因素、遗传性因素、感染性因素、内分泌性因素、解剖因素等。
习惯性流产是大都女性常碰着的事情，按照习惯性流产发生的时间，可以把流产分为早期习惯性流产和晚期流产。早期习惯性流产一般发生在妊娠12周以前，多和遗传因素、母体内分泌失调及免疫学因素等有关。晚期习惯性流产多发生在妊娠12周以后，和子宫畸形、宫颈发育不良、血型不合及准妈妈患其他疾病等因素有关。
另外，引起习惯性流产的病因复杂，有免疫性因素、遗传性因素、感染性因素、内分泌性因素、解剖因素等，临床上竟有43种疾病最终可导致习惯性流产的发生，而此中免疫性因素导致的流产占习惯性流产的67%之多。
引起习惯性流产的原因有许多，目前已证实于妊娠早期发生习惯性流产者，60%以上是由于孕妇或其爱人存在遗传基因缺陷或外界不良环境如放射、药物等影响从而导致胚胎染色体异常所造成。
所以，要治疗习惯性流产，先要排除一些已知的因素，像有没有感染、宫内有没有异物、有没有药物中毒或接受放射线治疗等。此外，需要接受体检及盆腔检查，看子宫大小、位置和附件是否出现畸形，由于这些都可能造成宝宝不能顺利出生的原因之一。
怎样减少流产的发生？发生习惯性流产，夫妻两边应做全面的体格检查，特别是遗传学检查，基因学的发展将会给患有习惯性流产的夫妻带来福音。找出造成习惯性流产的原因，按照原因加以防止与治疗才气有用的控制其发生。具体预防如下：
1、有子宫内口松弛的可做内口缝扎术。
2、发生流产后半年以内要避孕，待半年以后再次怀孕，可减少流产的发生。
3、做血型鉴定包罗rh血型系统。
4、要做遗传学检查，夫妻两边同时接受染色体的检查。
5、有甲状腺功能低下，要保持甲状腺功能正常后再怀孕，孕期也要服用抗甲低的药物。
6、注意休息，避免房事（尤其是［在］上次流产的妊娠期内），情绪稳定，生活规律有节。
7、男方要做生殖系统的检查。有菌精症的要治疗彻底后再使老婆受孕。
8、避免接触有毒物质与放射性物质。
