多酶片是生化类药品，在酸性条件下易被破坏，故服用时不可嚼碎或研碎。多酶片不宜与以下中药配伍使用：
含生物碱成分的中药
多酶片不宜与含生物碱成分的中药（如黄连、附子、麻黄、延胡索等）以及中成药（如知柏地黄丸、附子理中丸等）配伍，因两者可产生沉淀，使药效降低。
酸性中药
多酶片在中性或弱酸性环境中活性较强，遇酸则可使其失去活力。因此，在服用多酶片时，忌服酸性中药，如山楂丸等。
含鞣质的中药
含鞣质较多的中药及其中成药，如五味子、石榴皮、四季青片、感冒宁片、虎杖浸膏片、舒痔丸等，易与多酶片中含有的蛋白质中的肽键或酰胺键结合，发生化学反应，形成不易被胃肠道吸收的物质，从而引起消化不良、纳差等症状。
含大黄的中药
不同炮制方法的大黄对多酶片中胰蛋白酶的活性均有明显的抑制作用，如清宁片、解暑片、麻仁丸、牛黄解毒丸等含有大黄的中成药与多酶片同服，均可降低多酶片的作用。
含苷类的中药
含苷类成分的中药，如三七等，与多酶片配伍，可发生酶水解而失去活性，使疗效降低。
