生长环境不同。菊花均系栽培物，因产地不同可分为杭菊花、滁菊花、亳菊花等。野菊花为野生，多长于路边、丘陵、荒地、山坡等，全国大部分地区均有分布。
形色差异。菊花呈圆锥形或扁球形，花直径1.5~3厘米。花色多样，有黄色、棕色、白色等。野菊花呈类球形，花直径0.3~1厘米，花色多棕黄色，少量为褐色。
功效差异。菊花，性味甘、苦，微寒，归肺、肝经。功效是散风清热，平肝明目。常用于风热感冒（桑菊饮）、肝阳上亢之头痛眩晕目赤（羚羊钩藤汤）、肝肾阴虚之眼目昏花（杞菊地黄丸）等。现代研究表明，菊花能降血压、扩张冠状动脉增加血流量、增强毛细血管抵抗力，故还能治疗高脂血症、高血压及动脉硬化等。野菊花，性味苦、辛，微寒，归肝、心经，主要功效是清热解毒。主治痈肿、疔疮、目赤、瘰疬、天疱疮、湿疹等。由于清热解毒之力盛于菊花，它擅长治疗各类疔疮痈肿之疾（代表方有五味消毒饮）。此外，野菊花与菊花一样，也具有抗炎、抗病毒、降压、降脂等作用。
古人有“真菊延龄，野菊泄人”之说。菊花既是中药，也能当保健品食用，毒副作用极小。而野菊花性苦寒，长期服用或用量过大时，会伤及脾胃阳气，出现胃部不适、胃纳欠佳、肠鸣、大便稀溏等不良反应，脾胃虚寒者及孕妇都不宜用。所以菊花与野菊花在临床应用时不能混淆，更不能相互替代。
